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“哥伦比亚”号航天飞机进入轨道之后，宇航员给计算机输入轨道运行的工作程序，对飞行进行自控监视。然后，他们解开座椅安全带，在失重状态下，漂浮到飞行甲板处把货舱大门打开。航天飞机在轨道上飞行时必须打开货舱大门，以便将各种设备产生的热量散发到宇宙空间去。宇航员克里平在货舱中发现右舷轨道发动机吊舱部位有几块防热瓦片脱落了。地面控制中心立即召开了有几十名工程师参加的紧急会议。最后，把“不影响返航”的结论通知了“哥伦比亚”号。

入轨第一天，宇航员除克服失重外，主要工作是检查各种设备是否能运转正常，如测定座舱噪声，检查手动操纵和警报系统的可靠性。约翰·扬还带了一架７０毫米镜头照相机，忙于拍摄从空间遥望地球的奇妙美景。由于航天机是倒着绕地球飞行的，所以航天员可以打开货舱门清晰地遥望地球在自己身底下移动。他们看到了喜马拉雅山脉和亚马逊河。飞越地中海上空时，直布罗陀海峡，撒哈拉沙漠和那不勒斯海湾都历历在目。埃特纳火山上的烟雾缭绕，伊朗盐渍沙漠的彩色漩涡，都是地球上很难看到的奇景。

入轨第二天晚上，两位宇航员在驾驶舱内按规定开始８小时睡眠。驾驶舱温度控制在１５℃至２０℃之间。由于热控制器失灵，使舱内温度降至３℃。警报器唤醒了克里平，他启动备用加热器使温度恢复正常后，继续入睡。在８小时睡眠结束之际，休斯敦控制中心，向两位宇航员播放军号及唤人起床的音乐，以协调宇航员的时间节律。早饭后，地面控制中心向“哥伦比亚”号下达了准备返航的指令。

航天机在飞越太平洋关岛上空后，以２４５马赫的超高速进入大气层。与空气剧烈摩擦产生的超高温，将航天飞机银白色的外壳烧得通红。两位宇航员在驾驶舱内看到了机壳高温发出的粉红色辉光，他们拉下玻璃面罩使增压服完全密封。航天机外壳的高温引起了空气的电离，这使“哥伦比亚”号与地面的无线电通讯中断了１６分钟。当航天机飞下降到５０千米高空时，速度为每小时１０８００千米。２分钟后，离地面３８千米时，时速降为７６８０千米。为安全起见，约翰·扬改用手动操纵控制飞机着陆。